Il est d’usage de mettre une majuscule au mot musée pour insister sur la personnalité morale de l'établissement, surtout s'il appartient au domaine privé, ou sur son caractère unique.

Exemples :

- le Musée national des beaux-arts du Québec

- le Musée d'art contemporain de Montréal

- le Musée des beaux-arts de Montréal

- le Musée de la civilisation

- le Musée canadien des civilisations

- le Musée McCord d'histoire canadienne

- le Musée François-Pilote

C'est aussi la règle à suivre lorsque le musée est qualifié par un ou des adjectifs sans autre élément distinctif.

Exemples :

- le Musée ferroviaire canadien

- le Musée océanographique

Il faut toutefois noter que c'est la minuscule qu'on voit au mot musée dans de nombreux codes typographiques classiques; le nom du spécifique, domaine auquel le musée est consacré ou nom propre, s'écrit alors avec une majuscule.

Exemples :

- le musée des Arts décoratifs

- le musée de la Philatélie

- le musée de la Monnaie

- le musée de l’Amérique française

- le musée d'Orsay

- le musée du Louvre

- le musée Rodin